《新櫻花大戰》以架空年代「太正時代」的帝都東京為舞台。描繪了「帝國華擊團」對抗邪惡勢力的活躍表現，是一款戲劇 3D 動作冒險遊戲。

　　故事的開始時間設定在《櫻花大戰 5 ~再見，吾愛~》十二年後的帝都東京。主角神山誠十郎率領著「新帝國華擊團」，與再次現身於帝都的降魔，以及在世界各都市紛紛誕生的其他華擊團發生激烈衝突。